ดีเอสไอในฐานะที่เป็นหน่วยงานบังคับใช้กฎหมาย และเป็นสถานที่ราชการที่มีเอกสาร วัสดุอุปกรณ์ และยุทโธปกรณ์สำคัญจำนวนมาก จึงจำเป็นต้องตั้งศูนย์อำนวยการเฉพาะกิจภายใน เพื่อคอยเฝ้าระวังเหตุการณ์ตลอด 24 ชั่วโมง โดยช่วงนี้จะมีการเพิ่มเจ้าหน้าที่รักษาความปลอดภัยให้มากขึ้นกว่าเดิม และเพิ่มมาตรการรักษาความปลอดภัยให้เข้มงวดมากขึ้นตามสถานการณ์